当王阳明集中精力在解决田州、思恩事件的时候,广西的断藤峡和八寨等地又兴起了武装斗争,而且越来越严重,不仅影响了当地百姓的正常生活,也影响着朝廷对当地的管理。
断藤峡位于今天广西桂平市境内,是属于黔江下游的一条峡谷。在明朝时期,居住在断藤峡周边的多为少数民族。八寨是指当时的村寨,大多数位于今天广西壮族自治区永福县境内,在断藤峡以北。
断藤峡和八寨地区地形复杂,高山峻岭,对外的交通十分不便,但是这一大片区域又正好位于广西的腹地。从唐宋以来,断藤峡和八寨与田州、思恩一样实行土司土官制度。但是随着改土归流政策的传入,其内部的阶级矛盾加剧,同朝廷的矛盾也愈来愈激烈。
明朝从建立之初时,朝廷就开始对这一带用兵,企图压制不安分的武装势力。但是屡压屡起,到了嘉靖五年,朝廷将注意力放在田州和思恩时,断藤峡和八寨等地的武装活动大肆兴起。
王阳明处理完田州、思恩的事情后,便投身到平定断藤峡、八寨等地的武装斗争中来。当初招抚卢苏和王受时,两人为了感谢王阳明,曾经说只要朝廷有需要,便会义无反顾地听从调动。所以,此次围剿八寨等地的主力军队就是卢苏和王受的军队。
在进行围剿前,王阳明事先就对当地的实际情况进行了调查和了解。随后,王阳明指挥军队对断藤峡来了一场突然的袭击,当时的王阳明人还在南宁遣散湖广的士兵,实际上这群被遣散的士兵是在向桂平进军,没有人注意到这一点,所以断藤峡的闹事者被攻了个措手不及。紧接着按照早就安排好的,先是对磨刀、六寺、牛肠三个大寨进行攻击;接着又攻击了花相和仙台两个大寨。攻打的过程中,王阳明反复强调军事纪律,谨记此次行动的目的是安民定乱,不能够无事生非。整个战斗虽然没有预想中的好,但是也还算顺利,到最后基本上肃清了敌人,结束了断藤峡之战。
对于八寨的战役,在王阳明看来,其实同属一场战争。有了断藤峡之战的教训,八寨各处都生怕王阳明也来个突然袭击,就处处做好防范的准备。考虑到对地形的熟悉,王阳明重用卢苏和王受的军队,这次的行军又是秘密行事。四月二十二日夜,部队连夜悄悄地前进。第二天早晨,已经准备好的各路军队开始对八寨进攻。尽管八寨做好了防备,但突击还是起了效果,在各路军的勇猛进军下,各个山寨都纷纷被拿下。六月中旬,八寨战役基本结束。
令朝廷头痛了多年的断藤峡及八寨的闹事,王阳明仅用了一个多月的时间就平灭了,这出乎所有人的意料。当王阳明的《八寨断藤峡捷音疏》上报到朝廷的时候,朝野上下个个都惊叹不已,再加上王阳明并没有向朝廷多要一个兵,多要一份军饷,嘉靖皇帝甚至亲自写手诏问内阁王阳明是否夸大其词,得知真实情况之后皇帝终于知道了王阳明的才干,以及他所立的功业,他所经历的劳苦。
九月,朝廷对王阳明进行嘉奖。但是,除了表面上的奖励,和为招抚一事做出承诺之外,却再没有下文,王阳明关于招抚的很多建议也没有得到真正的实施。经过了这次战争,王阳明本来就很虚弱的身体更加虚弱了,再加上来到广西,水土不服,气候不适,身体更是一天不如一天。